Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00312Q9Y6C7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms