Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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