Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATG4BQ9Y4P1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms