Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPR55Q9Y2T6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GPR55Q9Y2T6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms