Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCQ9Y266 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms