Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVW-1Q9UQF0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ERVW-1Q9UQF0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms