Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SETD1BQ9UPS6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SETD1BQ9UPS6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms