Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHF8Q9UPP1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms