Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTF2Q9UNY4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTF2Q9UNY4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms