Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCG2Q9UNQ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms