Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN1Q9ULB1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRXN1Q9ULB1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms