Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms