Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AKAP11Q9UKA4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AKAP11Q9UKA4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms