Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRPC4Q9UBN4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms