Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RNF7Q9UBF6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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