Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms