Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL13Q9P2N7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL13Q9P2N7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms