Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP35Q9P2H5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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