Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SH3BP4Q9P0V3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SH3BP4Q9P0V3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SH3BP4Q9P0V3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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