Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP5Q9NZZ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHMP5Q9NZZ3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms