Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MIS18AQ9NYP9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MIS18AQ9NYP9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms