Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDAP2Q9NXN4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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