Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRMT1Q9NXH9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRMT1Q9NXH9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms