Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHCHD3Q9NX63 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHCHD3Q9NX63 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms