Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT57Q9NWB7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms