Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BSDC1Q9NW68 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BSDC1Q9NW68 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms