Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTLC3Q9NUV7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms