Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC4BQ9NT99 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms