Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPMQ9NSP4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPMQ9NSP4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms