Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms