Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms