Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NTN4Q9HB63 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms