Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDRD3Q9H7E2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDRD3Q9H7E2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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