Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLMPQ9H6B4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms