Protein–RNA interactions for Protein: Q9H299

SH3BGRL3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3Q9H299 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SH3BGRL3Q9H299 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SH3BGRL3Q9H299 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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