Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC90BQ9GZT6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC90BQ9GZT6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms