Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NMES1Q9C002 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms