Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
NSD3Q9BZ95 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSD3Q9BZ95 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms