Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC2Q9BYS8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC2Q9BYS8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms