Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GSDMCQ9BYG8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GSDMCQ9BYG8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms