Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms