Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC106Q9BWC9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC106Q9BWC9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 769.9 ms