Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIOK2Q9BVS4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIOK2Q9BVS4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms