Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NUP58Q9BVL2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NUP58Q9BVL2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms