Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTDSS2Q9BVG9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms