Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TUBA1CQ9BQE3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms