Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNS3Q9BQ31 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNS3Q9BQ31 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms