Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLCC1Q96S66 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms