Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PHF12Q96QT6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms