Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PKNOX2Q96KN3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKNOX2Q96KN3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms